MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Agrobacterium fabrum str. C58 chromosome linear

Total Repeats: 45739

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003063	CGGC	2	8	48746	48753	0 %	0 %	50 %	50 %	15891874
1002	NC_003063	CCG	2	6	48803	48808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891874
1003	NC_003063	GCAC	2	8	48811	48818	25 %	0 %	25 %	50 %	15891874
1004	NC_003063	CCG	2	6	48893	48898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891874
1005	NC_003063	GAT	2	6	48936	48941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891874
1006	NC_003063	TCG	2	6	49036	49041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891874
1007	NC_003063	ATG	2	6	49072	49077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891874
1008	NC_003063	CGA	2	6	49088	49093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891874
1009	NC_003063	CAT	2	6	49160	49165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891874
1010	NC_003063	TGC	2	6	49252	49257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891874
1011	NC_003063	CTC	2	6	49322	49327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891874
1012	NC_003063	ACG	2	6	49367	49372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185583
1013	NC_003063	GAA	2	6	49418	49423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159185583
1014	NC_003063	CG	3	6	49426	49431	0 %	0 %	50 %	50 %	159185583
1015	NC_003063	TGC	2	6	49434	49439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185583
1016	NC_003063	CGC	2	6	49478	49483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185583
1017	NC_003063	TCG	2	6	49635	49640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185583
1018	NC_003063	AGC	2	6	49644	49649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185583
1019	NC_003063	A	6	6	49844	49849	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_003063	T	6	6	49958	49963	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_003063	ATT	2	6	49978	49983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_003063	CG	3	6	50066	50071	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_003063	GTCA	2	8	50089	50096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_003063	TCG	2	6	50209	50214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185584
1025	NC_003063	TGA	2	6	50296	50301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185584
1026	NC_003063	CCA	2	6	50398	50403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159185584
1027	NC_003063	AAC	2	6	50405	50410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159185584
1028	NC_003063	GCGCTG	2	12	50444	50455	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	159185584
1029	NC_003063	CCG	2	6	50457	50462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185584
1030	NC_003063	GACC	2	8	50572	50579	25 %	0 %	25 %	50 %	159185584
1031	NC_003063	ATC	2	6	50637	50642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159185584
1032	NC_003063	TCG	2	6	50683	50688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185584
1033	NC_003063	CGA	2	6	50785	50790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185584
1034	NC_003063	AAC	2	6	50912	50917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	159185584
1035	NC_003063	ATCG	2	8	50930	50937	25 %	25 %	25 %	25 %	159185584
1036	NC_003063	CCG	2	6	50965	50970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185584
1037	NC_003063	CAC	2	6	51056	51061	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159185584
1038	NC_003063	TGA	2	6	51103	51108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185584
1039	NC_003063	T	6	6	51123	51128	0 %	100 %	0 %	0 %	159185584
1040	NC_003063	AGCGCC	2	12	51225	51236	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	159185584
1041	NC_003063	CAG	2	6	51329	51334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185584
1042	NC_003063	TCA	2	6	51415	51420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	159185584
1043	NC_003063	TCT	2	6	51487	51492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159185584
1044	NC_003063	CCT	2	6	51493	51498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159185584
1045	NC_003063	CGC	2	6	51500	51505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185584
1046	NC_003063	TTGAA	2	10	51522	51531	40 %	40 %	20 %	0 %	159185584
1047	NC_003063	TGA	2	6	51550	51555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185584
1048	NC_003063	CAG	2	6	51563	51568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185584
1049	NC_003063	CCGGAT	2	12	51600	51611	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	159185584
1050	NC_003063	CGAA	2	8	51649	51656	50 %	0 %	25 %	25 %	159185584
1051	NC_003063	CAC	2	6	51725	51730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	159185584
1052	NC_003063	T	7	7	51770	51776	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_003063	TGG	2	6	51822	51827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_003063	GCC	2	6	51888	51893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_003063	GAC	2	6	51894	51899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_003063	GCA	2	6	52041	52046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_003063	GTC	2	6	52238	52243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185585
1058	NC_003063	CG	3	6	52253	52258	0 %	0 %	50 %	50 %	159185585
1059	NC_003063	AGG	2	6	52272	52277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	159185585
1060	NC_003063	GAT	2	6	52394	52399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185585
1061	NC_003063	TCG	2	6	52410	52415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185585
1062	NC_003063	CTC	2	6	52424	52429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159185585
1063	NC_003063	TTC	2	6	52457	52462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	159185585
1064	NC_003063	TCG	2	6	52512	52517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185585
1065	NC_003063	CA	3	6	52540	52545	50 %	0 %	0 %	50 %	159185585
1066	NC_003063	GAA	2	6	52597	52602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159185585
1067	NC_003063	TCG	2	6	52611	52616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185585
1068	NC_003063	GGC	2	6	52648	52653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185585
1069	NC_003063	CTG	2	6	52662	52667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185585
1070	NC_003063	CG	3	6	52818	52823	0 %	0 %	50 %	50 %	159185585
1071	NC_003063	GCA	2	6	52896	52901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185585
1072	NC_003063	TGT	2	6	52960	52965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	159185585
1073	NC_003063	GAT	2	6	52979	52984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185585
1074	NC_003063	CGA	2	6	52998	53003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185585
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1076	NC_003063	ATGGC	2	10	53071	53080	20 %	20 %	40 %	20 %	159185585
1077	NC_003063	GC	3	6	53082	53087	0 %	0 %	50 %	50 %	159185585
1078	NC_003063	TGG	2	6	53088	53093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	159185585
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1080	NC_003063	ATG	2	6	53183	53188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185585
1081	NC_003063	CGGCT	2	10	53258	53267	0 %	20 %	40 %	40 %	159185585
1082	NC_003063	GGCA	2	8	53337	53344	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1083	NC_003063	CCT	2	6	53421	53426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_003063	CCT	2	6	53458	53463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_003063	T	8	8	53473	53480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_003063	ATT	2	6	53534	53539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	159185586
1087	NC_003063	CCT	2	6	53565	53570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	159185586
1088	NC_003063	CGT	2	6	53685	53690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185586
1089	NC_003063	AAG	2	6	53754	53759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	159185586
1090	NC_003063	CGAG	2	8	53766	53773	25 %	0 %	50 %	25 %	159185586
1091	NC_003063	GTC	2	6	53841	53846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185586
1092	NC_003063	CG	6	12	53907	53918	0 %	0 %	50 %	50 %	159185586
1093	NC_003063	CTGG	2	8	53967	53974	0 %	25 %	50 %	25 %	159185586
1094	NC_003063	TTGG	2	8	54167	54174	0 %	50 %	50 %	0 %	159185586
1095	NC_003063	CCCG	2	8	54192	54199	0 %	0 %	25 %	75 %	159185586
1096	NC_003063	GAC	2	6	54253	54258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185586
1097	NC_003063	GA	3	6	54265	54270	50 %	0 %	50 %	0 %	159185586
1098	NC_003063	GCG	2	6	54298	54303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185586
1099	NC_003063	TGC	2	6	54315	54320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185586
1100	NC_003063	GTC	2	6	54357	54362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185586
1101	NC_003063	TCCA	2	8	54364	54371	25 %	25 %	0 %	50 %	159185586
1102	NC_003063	CGA	2	6	54509	54514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185586
1103	NC_003063	CA	3	6	54692	54697	50 %	0 %	0 %	50 %	159185586
1104	NC_003063	GCC	3	9	54736	54744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185586
1105	NC_003063	CGA	2	6	54803	54808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_003063	GAA	2	6	54865	54870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891869
1107	NC_003063	TCA	2	6	54883	54888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891869
1108	NC_003063	ACA	2	6	54928	54933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891869
1109	NC_003063	GCT	2	6	54952	54957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1110	NC_003063	TCG	2	6	55123	55128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1111	NC_003063	TCC	2	6	55173	55178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891869
1112	NC_003063	GCA	2	6	55202	55207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1113	NC_003063	CGG	2	6	55240	55245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891869
1114	NC_003063	CAGAT	2	10	55248	55257	40 %	20 %	20 %	20 %	15891869
1115	NC_003063	CGGA	2	8	55282	55289	25 %	0 %	50 %	25 %	15891869
1116	NC_003063	CAGC	2	8	55306	55313	25 %	0 %	25 %	50 %	15891869
1117	NC_003063	A	7	7	55350	55356	100 %	0 %	0 %	0 %	15891869
1118	NC_003063	TCC	2	6	55394	55399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891869
1119	NC_003063	CGG	2	6	55471	55476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891869
1120	NC_003063	AG	3	6	55501	55506	50 %	0 %	50 %	0 %	15891869
1121	NC_003063	AGC	2	6	55641	55646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1122	NC_003063	CAGC	2	8	55670	55677	25 %	0 %	25 %	50 %	15891869
1123	NC_003063	AG	3	6	55732	55737	50 %	0 %	50 %	0 %	15891869
1124	NC_003063	GTCCG	2	10	55738	55747	0 %	20 %	40 %	40 %	15891869
1125	NC_003063	CCG	2	6	55816	55821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891869
1126	NC_003063	CAGC	2	8	55847	55854	25 %	0 %	25 %	50 %	15891869
1127	NC_003063	CAG	2	6	55889	55894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1128	NC_003063	CGCGG	2	10	55943	55952	0 %	0 %	60 %	40 %	15891869
1129	NC_003063	ACG	2	6	55956	55961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891869
1130	NC_003063	CAAC	2	8	55986	55993	50 %	0 %	0 %	50 %	15891869
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1140	NC_003063	TTG	2	6	56271	56276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891869
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1153	NC_003063	CGA	2	6	57091	57096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185587
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1158	NC_003063	CCAT	2	8	57290	57297	25 %	25 %	0 %	50 %	159185587
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1162	NC_003063	CGT	2	6	57580	57585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185587
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1246	NC_003063	GCA	2	6	61179	61184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891866
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1250	NC_003063	CT	4	8	61299	61306	0 %	50 %	0 %	50 %	15891866
1251	NC_003063	CGTC	2	8	61323	61330	0 %	25 %	25 %	50 %	15891866
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1254	NC_003063	CGC	2	6	61407	61412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891866
1255	NC_003063	T	6	6	61437	61442	0 %	100 %	0 %	0 %	15891866
1256	NC_003063	CAT	2	6	61468	61473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891866
1257	NC_003063	CCAG	2	8	61533	61540	25 %	0 %	25 %	50 %	15891866
1258	NC_003063	AAGCGG	2	12	61566	61577	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	15891866
1259	NC_003063	TGACC	2	10	61584	61593	20 %	20 %	20 %	40 %	15891866
1260	NC_003063	ACG	2	6	61643	61648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891866
1261	NC_003063	GAC	2	6	61675	61680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891866
1262	NC_003063	CGT	2	6	61681	61686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891866
1263	NC_003063	TTC	2	6	61759	61764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891866
1264	NC_003063	CTC	2	6	61765	61770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891866
1265	NC_003063	GCC	2	6	61771	61776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891866
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1267	NC_003063	GC	3	6	61876	61881	0 %	0 %	50 %	50 %	15891866
1268	NC_003063	GGC	2	6	61909	61914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891866
1269	NC_003063	CCG	2	6	61964	61969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891866
1270	NC_003063	CGC	2	6	61986	61991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891866
1271	NC_003063	TCC	2	6	62090	62095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891866
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1273	NC_003063	ATCA	2	8	62128	62135	50 %	25 %	0 %	25 %	15891866
1274	NC_003063	ATA	2	6	62146	62151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891866
1275	NC_003063	G	6	6	62273	62278	0 %	0 %	100 %	0 %	15891866
1276	NC_003063	ATC	2	6	62387	62392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891866
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1279	NC_003063	TCC	2	6	62540	62545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891866
1280	NC_003063	GGC	2	6	62552	62557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891866
1281	NC_003063	TCG	2	6	62606	62611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891866
1282	NC_003063	ACGA	2	8	62662	62669	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1283	NC_003063	CGC	2	6	62770	62775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1284	NC_003063	AAC	2	6	62834	62839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1285	NC_003063	CGC	2	6	62859	62864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1286	NC_003063	CAT	2	6	62901	62906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891865
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1289	NC_003063	GGC	2	6	63012	63017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891865
1290	NC_003063	ATC	2	6	63026	63031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891865
1291	NC_003063	ATC	2	6	63064	63069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891865
1292	NC_003063	GCG	2	6	63110	63115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891865
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1299	NC_003063	CGCA	2	8	63403	63410	25 %	0 %	25 %	50 %	15891865
1300	NC_003063	GATC	2	8	63452	63459	25 %	25 %	25 %	25 %	15891865
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1309	NC_003063	CGA	2	6	63918	63923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891865
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1322	NC_003063	GTT	2	6	64617	64622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891865
1323	NC_003063	CCGG	2	8	64637	64644	0 %	0 %	50 %	50 %	15891865
1324	NC_003063	ATTT	2	8	64694	64701	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1325	NC_003063	CGC	2	6	64702	64707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1326	NC_003063	GCTG	2	8	64713	64720	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1327	NC_003063	GGC	2	6	64954	64959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185589
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1334	NC_003063	CGG	2	6	65473	65478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185589
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1339	NC_003063	CGG	2	6	65646	65651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	159185589
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1343	NC_003063	GAT	2	6	65734	65739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	159185589
1344	NC_003063	CGA	2	6	65746	65751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	159185589
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1347	NC_003063	GCT	2	6	65884	65889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185589
1348	NC_003063	TCG	2	6	65901	65906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	159185589
1349	NC_003063	GCC	2	6	65923	65928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	159185589
1350	NC_003063	GAA	2	6	65963	65968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1351	NC_003063	CCG	2	6	66002	66007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891863
1352	NC_003063	CGC	2	6	66012	66017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891863
1353	NC_003063	CTGGT	2	10	66047	66056	0 %	40 %	40 %	20 %	15891863
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1359	NC_003063	GCC	4	12	66298	66309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891863
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1361	NC_003063	GGC	2	6	66439	66444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	15891863
1362	NC_003063	CGT	2	6	66459	66464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891863
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1366	NC_003063	AGCA	2	8	66691	66698	50 %	0 %	25 %	25 %	15891863
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1370	NC_003063	GCC	2	6	66930	66935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15891862
1371	NC_003063	TC	3	6	66977	66982	0 %	50 %	0 %	50 %	15891862
1372	NC_003063	GCCTCG	2	12	67090	67101	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	15891862
1373	NC_003063	GAC	2	6	67164	67169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891862
1374	NC_003063	CGCAAC	2	12	67224	67235	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	15891862
1375	NC_003063	GGCA	2	8	67435	67442	25 %	0 %	50 %	25 %	15891862
1376	NC_003063	GCGG	2	8	67454	67461	0 %	0 %	75 %	25 %	15891862
1377	NC_003063	CCT	2	6	67462	67467	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891862
1378	NC_003063	GTCA	2	8	67571	67578	25 %	25 %	25 %	25 %	15891862
1379	NC_003063	TCA	2	6	67582	67587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891862
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1381	NC_003063	TTC	2	6	67769	67774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891861
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